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历时15个月 云南怒江草果全基因组精细图谱绘制成功 |
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从20世纪70年代开始，云南省怒江州就开始种植草果，到2020年，种植面积已达111万亩，不仅是全国草果的核心产区，也是当地群众脱贫致富的重要经济作物。
为了加快提高草果遗传改良效率，培育高产、抗病、优质、安全新品种，对从源头创新保障草果明升健康可持续发展，2019年9月，怒江州联合华南农业大学等国内外高校科研院所机构，正式启动草果全基因组测序计划，历时1年零3个月，成功完成草果全基因组测序工作，绘制了精细图谱，并于1月13日正式对外发布。
通过Nanopore及illumina等测序技术，拼接组装得到2.08G大小的基因组，组装出由1145个contig序列组成的草果参考基因组序列，GC含量为40.9%，最长的contig长度为31.6Mb，N50为4.7Mb。结合HiC测序结果，得到24对染色体的高质量基因组，包括42394个基因。通过转录组、代谢组关联分析，得到草果关键香气物质合成的候选基因一批。草果全基因组精细图谱完成将极大推动草果的全基因组精准育种，为打造国家级草果种质资源圃提供重要基础作用。
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