《app》

app家完成人类肠内分泌细胞传感器的描述及功能验证

荷兰胡布勒支研究所的Hans Clevers等人完成了人类肠内分泌细胞（EEC）传感器的描述及功能验证。相关研究成果10月18日发表于《app》。

研究人员表示， EEC是肠道上皮细胞，通过分泌激素响应肠内容物，包括调节多种生理过程的促胰岛素激素，如胰高血糖素样肽1（GLP-1）和胃抑制肽（GIP）。激素的释放通过代谢物传感蛋白调控。低表达、物种间差异以及多种EEC亚型的存在给这些传感器的研究带来了挑战。

研究人员描述了胃EEC的分化，以补充现有的肠道类器官培养方案。CD200被确定为一种泛EEC表面标记物，使其能够对沿胃肠道的原代人类组织进行深度转录组分析。研究人员在22个受体中生成了功能缺失突变，并对类器官进行了配体诱导分泌实验。他们阐明了个别人类EEC传感器在激素（包括GLP-1）分泌中的作用。这些传感器可能成为影响食欲、肠道运动、胰岛素敏感性和黏膜免疫的潜在药理学靶点。

相关论文信息：

http://doi.org/10.1126/science.adl1460

生物多样性在生态系统中影响有机营养的可用性

瑞士苏黎世联邦理工学院的Cornelia W. Twining团队发现，生物多样性在水生和陆地生态系统中影响有机营养的可用性。相关研究成果10月18日发表于《app》。

研究人员将昆虫、蜘蛛的丰富度与生物量和来自溪流、陆地群落的多不饱和脂肪酸（PUFA）含量进行了关联分析，涵盖了9种土地利用方式。PUFA含量和生物量与生物多样性在不同生态系统中呈正相关。

在陆地生态系统中，人类主导的区域的生物量和PUFA含量低于更自然的区域，即使它们的丰富度相当。水生生态系统的PUFA含量始终高于陆地生态系统。这些研究结果强化了保护生物多样性的重要性，并突出了水生生物多样性的独特优势。

人类土地利用强化威胁着水生和陆地生态系统中节肢动物（如昆虫和蜘蛛）的生物多样性。然而，昆虫和蜘蛛群落的生物多样性与营养含量之间的联系尚未得到量化。

相关论文信息：

http://doi.org/10.1126/science.adp6198

《国家app院院刊》

20亿年来岛弧锶同位素与海水明升手机的时间协变

美国加州理工学院的Amanda L.Bednarick团队报道了20亿年来岛弧锶（Sr）同位素与海水明升手机的时间协变。相关研究成果近日发表于美国《国家app院院刊》。

岛弧玄武岩（IAB）的明升手机成分反映了地幔以及俯冲板块的流体和熔体的贡献。然而，岛弧岩浆岩87Sr/86Sr随时间的变化尚未得到充分研究。

研究人员收集了从现代到古元古代的岛弧岩浆岩的87Sr/86Sr数据。初始87Sr/86Sr值中位数与亏损地幔87Sr/86Sr相比持续升高，证明岛弧中的放射性Sr持续富集。岛弧87Sr/86Sr相对于亏损地幔的高度是可变的。新元古代晚期岛弧87Sr/86Sr的显著升高，与海水87Sr/86Sr和Sr浓度的急剧升高相吻合。

为了研究这种潜在的连通性，研究人员输入亏损地幔87Sr/86Sr、海水87Sr/86Sr和海水Sr浓度，建立了0~830Ma岛弧岩浆的87Sr/86Sr模型。该模型再现了汇编数据的总体轨迹。研究人员认为，岛弧87Sr/86Sr值的时间变化及其与海水明升手机波动的密切联系表明，海洋地球明升手机的变化强烈影响了岛弧岩浆的Sr同位素记录。

相关论文信息：

http://doi.org/10.1073/pnas.2401832121

《自然-方法学》

用于拍字节级光片显微镜数据的图像处理工具

美国加州大学伯利克分校的Srigokul Upadhyayula等人开发出用于拍字节（PB）级光片显微镜数据的图像处理工具。相关研究成果近日在线发表于《自然-方法学》。

光片显微镜是一种用于高速度三维成像亚细胞动态和大型生物样本的高效技术。然而，它通常会为单个实验生成数百GB到PB级的数据集。传统的计算工具处理这些图像的速度远低于获取图像的时间，并且由于内存限制，往往会完全失败。

研究人员推出PetaKit5D，这是一种可扩展的软件解决方案，用于高效的PB级光片图像处理。该软件包含一套经过优化的常用处理工具，以提高内存和性能。其进展包括快速的图像读取和写入、快速且内存高效的几何变换、高性能的Richardson-Lucy解卷积和可扩展的基于Zarr的拼接。这些功能在性能上超越了最先进的方法，并提升了一个数量级，能够以现代成像相机的全特拉体素速率处理PB级图像数据。该软件为通过大规模成像实验实现生物发现开辟了新途径。

相关论文信息：

http://doi.org/10.1038/s41592-024-02475-4