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SEL | 重新审视土壤真菌生物标志物和转换因子:磷脂脂肪酸、麦角固醇和 rDNA 拷贝数的种间差异 |
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论文标题:
期刊:
作者:Tessa Camenzind, Heike Haslwimmer , Matthias C. Rillig , Liliane Ruess , Damien R. Finn , Christoph C. Tebbe , Stefan Hempel, Sven Marhan
发表时间:21 Feb 2024
DOI:
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本研究主要介绍了土壤真菌生物标志物的精细转化因子、种间变异性、建模方法、ITS1拷贝差异、真菌生物标志物的组合以及它们在土壤生态学中的应用。研究提出了土壤真菌生物标志物的精细转化因子,并发现:
• 所有真菌生物标志物都存在较高的种间变异性;
• 建模方法支持不同土壤中生物标志物估计的有效性;
• ITS1拷贝差异很大,但具有真菌特异性,系统发育偏差最小;
• 真菌生物标志物的组合将揭示土壤真菌的生理和活性。
土壤中真菌和细菌的丰度可作为碳动态的简单预测指标,并代表了广泛可利用的微生物特征。尽管不能定量微生物生物量本身,但土壤生物标志物可以作为这些微生物群的定量估计。因此,需要对微生物碳库进行精确转换,并了解其在不同土壤中的可比性。本研究改进了经典真菌生物标志物的转化因子,并评估了定量PCR(qPCR,rDNA拷贝)作为土壤真菌生物标志物的应用。根据30株分离株纯真菌培养的生物标志物含量,结合现有文献,本研究提出平均转化因子为95.3 g真菌C g-1麦角甾醇、32.0 mg真菌C µmol-1 PLFA 18:2ω6,9和0.264 pg真菌 C ITS1 DNA copy-1。与预期的一样,尽管qPCR结果显示的系统发育偏差最小,但种间变异在rDNA拷贝中最为明显。一种基于典型农业土壤的建模方法进一步支持了这一假设,即土壤的高多样性可以缓冲生物标志物的变异性,而系统发育偏差也会影响生物标志物估算比较的准确性。研究分析表明,qPCR结果最能覆盖土壤中的真菌群落,但在高多样性的土壤中,这种变异性只能被部分抵消。PLFA 18:2ω6,9和麦角甾醇是量化子囊菌群和担子菌群的准确生物标志物。总之,在将生物标志物数据应用于全球模型之前,对其进行生态学解释和覆盖非常重要,在这种情况下,将不同的生物标志物结合起来可能最有洞察力。
作者及团队介绍
Tessa Camenzind(第一作者,通讯作者),柏林自由大学植物生态学博士后。研究方向为真菌和微生物在土壤养分循环和碳动态中的作用,尤其是真菌的养分利用效率和土壤中的碳循环。
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土壤生物地球明升手机循环
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土壤污染与修复
土壤动物及其生态功能
期刊简介
Soil Ecology Letters(SEL) 由高等教育出版社与明升中国app院城市环境研究所共同主办,SpringerNature海外发行。报道领域包括:土壤生物多样性、土壤互营和食物网、土壤微生物组、土壤—植物相互作用、土壤生物地球明升手机循环、土壤生物修复和恢复、土壤多功能性、土壤生物对环境变化的响应和适应、土壤生态过程的突破性技术、新理论和模型。栏目包括但不限于:letter to editor, perspective, review, rapid report, research article, commentary, SEL digest。
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