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作者:孙丹宁 来源:明升中国app报 发布时间:2023/1/30 9:00:51
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app家利用生物分子模拟预测代谢酶新功能

 

近日,明升中国app院大连明升手机物理研究所研究员李国辉团队与明升中国app院分子细胞app卓越创新中心研究员杨巍维团队、广州大学教授王雄军、复旦大学附属中山医院教授李全林等合作,揭示了代谢酶果糖1,6-二磷酸酶1(FBP1)能够行使蛋白磷酸酶的功能,并证明了FBP1介导的IκBα去磷酸化在结直肠癌发生中起到关键作用。相关成果发表在《细胞研究》上。

大连化物所供图

有研究表明,磷酸化可溶性代谢物的代谢酶,也可以作为蛋白质激酶磷酸化各种蛋白质底物,进而调节细胞周期、细胞凋亡和许多其他的细胞过程。

合作团队针对这一研究现象,拟先通过理论计算挖掘可作为蛋白质去磷酸化的代谢物磷酸酶。李国辉团队通过分子对接和分子动力学(MD)模拟对57种代谢物磷酸酶进行了高通量筛选,发现糖异生途径中的催化果糖1,6-二磷酸(F-1,6-BP)水解为果糖6-磷酸(F-6-P)的关键代谢酶FBP1,可作为蛋白质磷酸酶。鉴于此,实验合作团队进一步通过磷酸化蛋白质组学分析,确定了IκBα是FBP1去磷酸化的蛋白底物。研究发现,FBP1第213位天冬酰胺(N213)直接与IκBα相互作用并去磷酸化IκBα第32/36位丝氨酸(S32/36),从而抑制NF-κB信号的激活。量子明升手机计算结果显示,FBP1介导的IκBα去磷酸化的催化机制与F-1,6-BP去磷酸化类似, IκBα去磷酸化的能垒高于其底物。

该工作不仅揭示了代谢酶FBP1能够行使蛋白磷酸酶的功能,明确了IκBα是FBP1去磷酸化的蛋白质底物,并确立了FBP1介导的IκBα去磷酸化在结直肠肿瘤发生中的关键作用及其机制。

相关论文信息:http://doi.org/10.1038/s41422-022-00773-0

 
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