人工智能工具正在帮助app家设计出形状不同于任何自然界结构的蛋白质
(图片来源:Ian C HaydonUW Institute for Protein Design)
随着人工智能(AI)的巨大进步,美国西雅图华盛顿大学(UW)生物明升手机家David Baker领导的一个团队,只需几秒钟便可以设计出“原创”新蛋白质。相关研究发表于9月15日出版的《app》。最初,研究人员构想出一种新蛋白质的形状——通常是将其他蛋白质的片段拼凑在一起,然后由软件推导出与该形状对应的氨基酸序列。但在实验室中制作这些“草稿”蛋白质时很少能折叠成所需的形状,相反,它们最终被卡在不同的状态。而通过调整蛋白质结构预测软件AlphaFold和其他AI程序,这一耗时的步骤可以瞬间完成。在Baker团队开发的一种名为“幻觉”的方法中,研究人员将随机的氨基酸序列输入结构预测网络;根据网络的预测,改变其结构,使之变得更像蛋白质。
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