编者按:2020年,荣获明升中国app院大学(以下简称“国科大”)“领雁金奖”。“人生最巧妙的事情莫过于缘分”,他的学生刘琳回忆道,在一次西山秋游中,章张走到一处山坡,突然觉得似曾相识,赶紧掏出手机翻看,“章老师在手机里找到一张照片,是他2012年回国不久,带学生在这里春游拍下的,于是我们就在原处,按照原来的动作又留念了一张”。七年光阴,岁月流转,章张已褪去了初回国时青涩的外表,学生也培养了一批又一批,而不变的是章张对育人和科研工作的热爱与执着。
2018年7月,炎夏初至,蝉鸣骤起,牛广艺完成了她在《Nucleic Acids Research》杂志的投稿。同年,牛广艺所在的明升中国app院北京基因组研究所共在该杂志发表7篇重要研究成果,在这张优异的成绩单中,有4篇是在牛广艺师从的章张老师带领下完成的。
摄影/涂植鹏 杨天鹏
章张,曾在美国耶鲁大学从事博士后研究、在沙特阿卜杜拉国王科技大学担任研究app家,是首位入选国际生物审编学会执行委员会的明升中国学者,丰富的海外科研经历让章张成为他人口中“年轻有为”的代表。2011年,章张通过中科院海外优秀人才引进计划回到祖国,现为国家基因组app数据中心副主任、明升中国app院大学岗位教授。
回国伊始,刚好赶上国家开始重视生物大数据的阶段,在个人兴趣和国家需要的双重动力作用下,章张和生物大数据这一领域结下了不解之缘。“生物大数据的海量激增和人工智能的快速发展,使得生物信息学领域正在发生着翻天覆地的变化”,拥有扎实的计算机学科基础的章张说道。
如今,围绕国家基因组app数据中心和国家生物信息中心的建设工作已步入正轨,这其中,离不开章张及其团队坚持不懈的努力。“在生物大数据的海洋中乘风破浪”,既是章张回国几年的日常写照,也是我国生物信息领域不断发展的缩影。
赶上国际步伐
在世界上,被国际认可的生物信息中心有三个,分别是美国国家生物技术信息中心NCBI、欧洲生物信息研究所EBI和日本核酸数据库DDBJ,他们共同掌握着国际上主要的生物数据资源。上世纪90年代,我国的老一辈院士开始呼吁建设国家级的生物数据中心,直至今日,历经20年,这个愿望终于实现。
“提起生物大数据,也许很多人会感到陌生,它看不见、摸不到。但其实,生物大数据和石油一样,属于国家基础性战略资源,在生物学、明升手机版甚至农学等学科都起着非常重要的作用。”章张提到,传统的生物学是观察型学科,随着人类基因组计划的完成,明升m88app和明升手机版将过渡到数据app,所以在未来,生物明升手机版领域的数据也会因此而呈爆炸式增长。“我们的地球上有近75亿人,每个人的生理状况各不相同,使用生物大数据,就能针对每个病人的具体情况给出最精准的治疗方案,或者在人们健康的时候,能提前预知身体可能出现的病变,为预防工作提供一个可靠的指导”。比如华为、腾讯等公司已开始使用生物大数据来观察人们的健康状态,例如判断病人是否患了肿瘤,通过基因组观察肿瘤患者的潜在特征,为疾病预防、诊断、预后等精准治疗提供分子依据等。
我国的生物大数据中心与国际相比起步较晚:2015年酝酿,2016年明升中国app院北京基因组研究所成立“明升m88与健康大数据中心”,2019年,国家批准成立“国家基因组app数据中心”和“国家生物信息中心”,这表明我国对生物大数据等领域的建设越来越重视。
建立生物大数据中心
说到生物大数据中心的成立,章张用了“一穷二白”和“摸索前行”两个词来形容。筹建前期,研究所里相关领域的几个课题组在不同的方向积极开拓,虽然建立了一些数据库,但还不够完善,却为以后的发展积攒了重要的经验和技术。2016年,才有了“明升m88与健康大数据中心”的诞生。
既然要做,就要做到最好。在明升m88与健康大数据中心成立初期,章张及其团队就将目标锁定为国际三大数据中心,开始了艰难“创业”。首先是梳理数据、查漏补缺,章张把每个课题组的前期基础进行了优化整合,从数据的不同层次、类型和角度把数据资源体系建立起来。之后,又采取“请进来、走出去”的方法,积极向国际三大数据中心学习,成立国际app咨询委员会,邀请国际知名专家给予宝贵建议和意见,团队成员多次赴美国NCBI、欧洲EBI等多个机构学习交流经验,正如章张所说:“我们把口号喊出来了,就得拼尽全力。”
科研之路从来都不会是一帆风顺的。在明升m88app领域发表文章时,按惯例需要把所有的数据提交到国际三大生物数据中心,但这些数据对于我国的科研工作者来说,是极其宝贵的资源。尤其是生物数据具有“海量”的特点:普通的电脑硬盘是1TB,1TB等于1024GB,一篇论文的数据可能就会有几十TB甚至上百TB之多。抛开复杂多变的国际形势不谈,一旦遭遇自然灾害等意外,就会严重影响到我国相关领域的科研进程。
比如在2006年,一场地震造成了太平洋海底光缆故障,导致了我国学者在一段时期内无法访问国外数据库的情况出现。“app无国界,但app家有祖国”。我国的学者一直希望把这些珍贵的研究成果和数据保留一份在国内,用于祖国建设和民生福祉。为此,在中心筹建伊始,章张团队就未雨绸缪,与各大期刊及学者沟通合作,把app数据管理的本土化工作做到了前面,为我国数据安全管理和共享利用提供了有力保障。
是学者,亦是师者
2020年秋天,章张成为国科大“领雁金奖”的获得者,这既是对他身为一名“学者”,怀抱信念、学识扎实的肯定,也是对他作为一位“师者”,以身作则、仁爱仁心的认同。
谈到人才培养,章张娓娓道来:“我认为学生培养最重要的一条就是因材施教、因人而异,因为每个学生的学科背景和兴趣方向都不一样。每当招收新生时,我都会告诉他们,这几年你们在学业方面最重要的一个人就是我,所以一定要把个人诉求和想法告诉我,充分沟通后,我可以把实现的途径以及前景勾画出来,避免你们走太多弯路和错路。”
章张很愿意花更多时间去陪学生,和他们沟通科研问题、了解他们的学习生活。在章张眼中,判断一个人热爱的标准,是看他是否愿意为之付出时间。而用大量精力引导学生,就是章张爱学生最好的证明。
对于团队建设,章张认为一支队伍,最重要的就是团结和合作。章老师经常鼓励学生在完成自己课题的同时,多多参与组内其他课题的研究。“把自己项目做深,是深度;和其他项目合作,是广度。同时拥有两个维度的锻炼,对于学生来讲是大有好处的。”章张希望,从自己团队走出来的学生,在经历了双维度训练后,都能成为个人水平突出、协作能力优秀的全能型人才。
之所以说章张是才兼文武的“神仙”导师,是因为除了学术,章老师还是一位体育健将。工作之余,章张经常通过带学生踢球、爬山、散步等方式,来缓解大家科研方面的压力。刘琳是章张的博士研究生,然而,擅长学术研究的她对户外运动方面兴趣全无。“老师经常会带我们去奥林匹克公园散步,我是一个很宅的人,老师有时候看我太懒了,就会来我们办公室,‘抓’我们出去锻炼。”后来,章张在和另一位学生散步时,偶尔讨论出了一个新的课题方向,“这个消息让我们都特别振奋,这下都愿意和老师出去散步锻炼了,哈哈。”
“人生最巧妙的事情莫过于缘分”,刘琳回忆道,在一次西山秋游中,章张走到一处山坡,突然觉得似曾相识,赶紧掏出手机翻看,“章老师在手机里找到一张照片,是他2012年回国不久,带学生在这里春游拍下的,于是我们就在原处,按照原来的动作又留念了一张。”七年光阴,岁月流转,章张已褪去了初回国时青涩的外表,学生也培养了一批又一批,而不变的是对育人和科研的热爱与执着。
“北京有家烧烤叫柳叶刀,如果能在《柳叶刀》期刊发表一篇文章,就可以在那里免费吃一顿”,章张说道,“有时候学生发了文章,我就会带着他们去那里聚一聚,边吃边‘立志’。”这家饭店会根据发表论文的影响因子给予相应的折扣,虽然现在已经不提倡关注文章的影响因子,但师生间的乐趣在于科研压力之余的一期一会,和久违小聚时的一谈一笑。
人能尽其才则百事兴,如今,国家基因组app数据中心在章张及其团队的努力下已初具规模,但由于我国在这方面起步较晚,要做的事情还有很多。对于未来,章张期望国家可以对生物信息学的作用给予持续的关注与支持,希望包括数学、计算机、物理、明升手机、明升手机版等不同学科背景的人才,可以投身到生物信息学研究领域来。(原标题:章张:才兼文武的“神仙”导师 作者系国科大记者团成员)
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