本报上海1月16日讯（记者黄辛）中科院分子植物app卓越创新中心/植物生理生态研究所和上海师范大学明升m88与环境app学院黄学辉团队合作，首次绘制了栽培稻—野生稻的泛基因组图谱，并系统鉴定了涵盖各类群水稻的编码基因集。今天，这一成果以长文形式在线发表于《自然—遗传学》杂志。

从野生稻驯化而来的水稻品种众多、分布广泛，除了全亚洲，在欧洲、美洲和澳洲也有很少量分布。水稻可以适应多样的生态环境和农艺条件，其丰富的遗传多样性在驯化和现代育种中都发挥了重要作用，并将成为应对粮食需求增长和环境变化，进行品种改良的关键资源。

据了解，20多年来，粳稻“日本晴”一直是水稻研究的模式材料。在之前的研究中，水稻基因组的遗传变异鉴定大多依赖于其序列与粳稻“日本晴”的相似性。然而，粳稻“日本晴”不能涵盖栽培稻和普通野生稻中所有的功能基因。比如，耐水淹基因、高效吸收磷肥基因等在“日本晴”等水稻品种中完全缺失。

黄学辉告诉《明升中国app报》记者，研究团队选取了66个来自不同水稻类群的栽培稻品种和野生稻株系，对它们进行深度测序、从头序列组装和基因注释分析，获得了水稻各类群材料的精细基因组图谱，鉴定出了水稻基因组中各类复杂的遗传变异，并且发现很多功能基因存在多种等位基因类型。此外，新鉴定的很多编码基因存在转录产物和蛋白质功能结构域，暗示可能存在一定的生物学功能。

相关专家表示，此项成果将有助于精确发掘复杂农艺性状的关键变异位点，有力推动水稻的功能基因组学研究，有助于育种家充分利用各类群水稻中丰富的遗传变异，为进一步提升我国水稻的产量潜力、抗逆特点等提供了重要的基础信息。