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作者:黄辛 来源: 发布时间:2018/1/17 9:17:54
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app家首次绘就水稻泛基因组图谱

 

本报上海1月16日讯(记者黄辛)中科院分子植物app卓越创新中心/植物生理生态研究所和上海师范大学明升m88与环境app学院黄学辉团队合作,首次绘制了栽培稻—野生稻的泛基因组图谱,并系统鉴定了涵盖各类群水稻的编码基因集。今天,这一成果以长文形式在线发表于《自然—遗传学》杂志。

从野生稻驯化而来的水稻品种众多、分布广泛,除了全亚洲,在欧洲、美洲和澳洲也有很少量分布。水稻可以适应多样的生态环境和农艺条件,其丰富的遗传多样性在驯化和现代育种中都发挥了重要作用,并将成为应对粮食需求增长和环境变化,进行品种改良的关键资源。

据了解,20多年来,粳稻“日本晴”一直是水稻研究的模式材料。在之前的研究中,水稻基因组的遗传变异鉴定大多依赖于其序列与粳稻“日本晴”的相似性。然而,粳稻“日本晴”不能涵盖栽培稻和普通野生稻中所有的功能基因。比如,耐水淹基因、高效吸收磷肥基因等在“日本晴”等水稻品种中完全缺失。

黄学辉告诉《明升中国app报》记者,研究团队选取了66个来自不同水稻类群的栽培稻品种和野生稻株系,对它们进行深度测序、从头序列组装和基因注释分析,获得了水稻各类群材料的精细基因组图谱,鉴定出了水稻基因组中各类复杂的遗传变异,并且发现很多功能基因存在多种等位基因类型。此外,新鉴定的很多编码基因存在转录产物和蛋白质功能结构域,暗示可能存在一定的生物学功能。

相关专家表示,此项成果将有助于精确发掘复杂农艺性状的关键变异位点,有力推动水稻的功能基因组学研究,有助于育种家充分利用各类群水稻中丰富的遗传变异,为进一步提升我国水稻的产量潜力、抗逆特点等提供了重要的基础信息。

《明升中国app报》 (2018-01-17 第1版 明升要闻)
 
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