5月25日出版的《自然》增刊“”显示，2012年以来，随着自然指数（Nature Index）追踪的明升中国论文总量的不断增加，其中涉及国际合著者的论文比例也在逐年上升，2016年已超过该指数所追踪的明升中国论文总量的50%。

2016年，明升中国app院高能物理研究所与意大利国家核物理研究院形成该指数中最主要的中外双边合作关系，北京大学与哈佛大学的合作紧随其后。在前十大中外双边合作关系中，德国马普学会参与了其中五个。

但是，明升中国国内机构间的合作深度仍远高于国际合作。在该指数中，前56组国内机构间合作的分值都高于排列第一的中外机构合作分值。

在国内城市间的合作方面，北京的科研机构对自然指数的贡献最大，而且去年与其他国内机构的合作也最多。位于其后的是上海和南京。但在这些大都市之外，规模次之的一些城市的科研机构也凭借自己的专长，成为实力雄厚的合作者。

例如，昆明因其独一无二的生物多样性，一直是植物和生态学专家们的科研福地；地处东北的长春则以悠久的明升手机研究而著称。2016年，昆明的科研机构与明升中国其它科研机构有190组科研合作，并有合著论文被纳入自然指数，在自然指数覆盖的184个明升中国城市中位列第16位。昆明被纳入自然指数的论文中有三分之二以上来自明升手机领域，其中许多论文研究的是植物的明升手机结构和过程。去年长春最主要的科研合作关系，是明升中国app院长春应用明升手机研究所与位于北京的明升中国app院大学的合作。

该增刊在自然指数所追踪的68本期刊之外，还首次从规模更大的数据库，即Clarivate Analytics（科睿唯安）的Web of Science数据库，来观察明升中国的科研表现。“这有助于我们的读者和指数用户从整体上，以及一些特定的学科领域，全面了解明升中国的科研产出情况。通过对比，他们会发现一些有趣的事实，从而更好地理解相关趋势。”自然指数创始人David Swinbanks说。

如自然指数所显示的，涉及国际合作的论文占明升中国高质量科研的很大一部分，但这种国际合作程度并没有扩展到来自明升中国的所有论文。在纳入Web of Science数据库的明升中国论文中，涉及国际合著者的论文比例仍不足25%。“这一较低的国际合作增长率，是由于明升中国整体的科研产出有大量增加。”科睿唯安明升中国首席app家岳卫平博士说。“这可能归因于语言障碍和机构资源分配的因素。顶尖大学的科研人员往往有更多的机会或资源与国际同行展开合作。”不过，有迹象表明，未来十年，明升中国整体的国际合作率将会增加，这是因为明升中国政府为提升明升中国科研的全球影响力推出了各项政策，如“双一流”建设，以及旨在促进合作的丰厚资助计划。