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app家发现精子中一个来源于28SrRNA的新小RNA |
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5月10日,国际学术期刊《分子细胞生物学杂志》(J Mol Cell Biol)在线发表了明升中国app院生物明升手机与细胞生物学研究所张永莲研究组的最新研究成果:A sequence of 28S rRNA-derived small RNAs is enriched in mature sperm and various somatic tissues and possibly associates with inflammation。
近年来,除了miRNAs和piRNAs,其他种类的小非编码(sncRNAs)被不断发现,例如来源于tRNA的tsRNAs。rRNA作为细胞中另一种重要housekeeping RNA,是否也能产生类似tsRNAs的小RNA?目前仍缺乏深入研究。在研究员张永莲和副研究员周玉传的指导下,助理研究员储辰、余璐等人对小鼠精子中的小非编码RNA进行深入研究,发现一个来源于28S rRNA,序列特点上与已知tsRNAs十分相似的sncRNA(rsRNA-28S)。进一步研究发现,小鼠现有基因组数据中并不包含rsRNA-28S所对应的DNA序列信息,在前人利用RNA-seq对小鼠精子小RNA的研究中,常规的genome mapping方式对测序数据进行处理时将rsRNA-28S误认为无法mapping的垃圾序列而丢弃。通过定量实验,研究人员发现rsRNA-28S在小鼠精子中的丰度甚至高于已知的tsRNAs,同时其还在多个体细胞中存在表达。体细胞的rsRNA-28S能响应LPS刺激发生表达改变,而对数十例人精子样品的筛查发现,生殖道炎症病人白细胞增多症精子中的rsRNA-28S发生了显著变化。这项研究发现了一个和已知tsRNAs十分类似的rsRNA,揭示了现有genome mapping方法在小RNA测序分析中的不足,并探索了rsRNA-28S的功能。这些结果提示细胞中可能存在一类“housekeeping RNA-derived”小RNAs,而并非仅仅是来自tRNA的tsRNA。
该研究工作得到了研究员陈德桂、刘默芳、王红艳,上海市计划生育研究所研究员施惠娟以及法国Clermont Université教授Joël R. Drevet的大力协助,并得到了国家自然app基金委、科技部的研究经费资助及生化与细胞所分子生物学技术平台的支持。
图:白细胞增多症病人与正常人精子中的rsRNA-28S有显著差异。相比正常精子,白细胞增多症病人精子rsRNA-28S的Upper band显著缺失,这或能作为一种新的临床精子检测Marker。
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