据日本共同社报道，世界卫生组织(WHO)应对新型流感的技术部门负责人进藤奈邦子日内瓦时间5月3日表示，“有可能出现了对主要流感治疗药达菲(tamiflu)具有耐药性的(新型流感)病毒”，十分担忧出现使用达菲无效的病毒。
由于目前疫苗研制工作尚未完成，治疗新型流感大多依赖于达菲。如果出现耐药性病毒，通常对病毒抵抗力较弱的婴幼儿、高龄者、艾滋病和糖尿病患者等将面临极大危险，WHO和各国政府不得不彻底修改整个治疗体系。
进藤表示，2007年至2008年冬北美地区流行的季节性流感病毒(H1N1型)和此次新型流感病毒类型相似，该病毒中的一部分已具有很强的耐药性，达到了“不投放超过通常用量约400倍的达菲就没有疗效”的程度，达菲“实际上已无法用于治疗”。据悉，目前在北美和中南美，该类型的病毒几乎都对达菲具有耐药性。
进藤指出，南半球即将进入流感高发期，“可以预料”耐药性病毒和新型流感病毒“非常有可能杂交”，暗示虽然目前还没有具体征兆，但实际上有出现具有耐药性的新型流感病毒的危险。
报道称，对新型流感有效的治疗药除达菲外还有瑞乐沙(relenza)，不过由于该药价格较高因此流通量极少，WHO也几乎没有可用于发展明升中国家的库存储备。
另悉，美国研究小组4日汇总了在全球范围内扩散的新型流感病毒(H1N1)的分析结果，称该病毒是包括猪的两种病毒在内，至少4种病毒混合而成的。
流感病毒共有8个基因分段。据美国哥伦比亚大学等分析表明，其中6个基因分段属于北美猪流感病毒，剩下2个分段来自亚欧猪流感病毒。
在北美猪流感病毒中也混杂着来自禽类和人的病毒基因。该研究小组认为从以往的检验情况来看，到1998年左右为止在北美猪的体内就混杂了来自猪、禽类、人的流感病毒。
据美国疾病对策中心(CDC)截至到4日的分析结果表明，新型流感病毒并不具有1918年席卷全球的西班牙流感病毒所持有的遗传基因。结果表明相比西班牙流感，新型流感病毒的病原性较弱。
一名CDC官员在美国FOX电视台的节目上也称“这是个好的兆头”，然而“不能说我们已经摆脱了危机”。